在巴西最大的城市圣保罗确诊拉丁美洲首例冠状病毒后仅两天，阿道夫卢茨研究所(IAL)，巴西圣保罗大学(USP)和英国牛津大学的研究人员就发表了该病毒的完整基因组序列，他们称为2型严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV-2)。

　　该报告于2月28日在发布，Virological.org是病毒学家，流行病学家和公共卫生专家使用的讨论和数据共享论坛。这种信息有助于了解该病毒如何在世界范围内传播，并有助于开发疫苗和诊断测试。

　　“通过对基因组进行测序，我们更加接近了流行病的起源。我们知道巴西确诊的病例来自意大利，但是意大利人尚不知道伦巴第大爆发的起源，因为他们尚未对样品进行测序。他们尚未确定零号患者，也不知道他或她是直接来自中国还是来自其他国家。”USP热带医学研究所(IMT)负责人埃斯特萨比诺(Ester Sabino)告诉AgnciaFAPESP。

　　根据萨宾诺的说法，巴西的第一个序列与1月28日在德国测序的样品非常相似，与中国流行病中心武汉的基因组序列不同。“这种病毒的变异相对较小，平均每月一次，因此对基因组的小片段进行测序毫无意义。为了了解病毒是如何传播和进化的，我们必须绘制整个基因组图。”她说。

　　IAL的研究人员还于2月29日对从第二名诊断为COVID-19的巴西确诊患者中分离出的冠状病毒的整个基因组进行了测序。该研究在巴西确诊后仅24小时完成从第一和第二位患者分离出的病毒的基因组之间存在差异。

　　“第二个巴西基因组与英国测序的基因组更为相似，并且都与中国序列不同。这就意味着从欧洲国家内部传播已经开始的意义上讲，COV-19流行病在欧洲正在逐渐成熟。”

　　她补充说，正在进行的监测过程将使科学家能够鉴定出变异最小的病毒基因组区域，这是开发疫苗和诊断测试的重要步骤。她说：“如果测试的目标是一个经常发生突变的区域，那么灵敏度丧失的可能性将会很高。”

　　牛津大学教授Sabino和Nuno Faria是巴西-英国虫媒病毒发现，诊断，基因组学和流行病学中心(CADDE)的共同负责人。该项目在FAPESP，英国医学研究理事会和牛顿基金会的支持下，旨在对登革热和寨卡病毒等虫媒病毒进行实时流行病学分析。

　　萨比诺说：“该项目已经建立了一个研究人员网络，致力于应对流行病并实时分析流行病学数据。”“目标是为卫生服务提供真正的帮助，而不仅仅是在问题发生后的几个月内发布信息。”

　　据萨宾诺说，一旦中国在1月份确认首次爆发COVID-19，项目团队便动员起来，获得了必要的资源，以便在病毒到达巴西后对其进行测序。

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